1983年南開大學環境科學系成立，這是我國綜合性大學中最早成立的環境科學系，戴樹桂教授任系主任。1998年成立環境科學與工程學院，朱坦教授任院長。學院現有天津市重點實驗室“城市化中生態修復與污染防治”，正在向國家環?？偩稚陥蟮?ldquo;國家環境保護城市空氣顆粒物污染防治重點實驗室”已進入評審。學院設有8個教學與研究機構：環境科學系；環境工程與管理系；環境科學研究中心；南開大學環境與社會發展研究中心；南開大學環境評價與規劃所；南開大學泰達膜分離技術研究開發中心；南開大學城市公共安全研究中心；和南開大學戰略環境評價中心。

學院具有完整的學士、碩士和博士三級教學體系。2000年首批成為環境科學與工程一級學科博士學位授權點單位、并擁有環境科學與工程博士后流動站。2001年環境科學專業被教育部批準為國家重點學科。在連續兩屆被教育部聘為環境科學教學指導委員會副主任成員單位后，又成為2001-2005年教育部高等學校環境科學與環境工程教學指導委員會副主任單位、環境科學類專業教學指導分委員會主任單位。以及國務院學位委員會學科評議組成員單位。學院49名教師中包括了國內著名學者和“跨世紀優秀人才”，以及南開大學特聘教授，其中正、副教授30人，正教授幾乎都是博士生導師。青年教師的比例占整個教師隊伍的80%以上，已形成了老中青結合的、專業知識結構合理的、具有學術特色的學術梯隊。學院每年招收本科生80多人，碩士、博士研究生100多人，本科生和研究生的比例達到1.3：1。實現了研究型大學的合理比例。學院已培養出千余名畢業生，他們大多從事國家環境保護的科研、教學和管理工作，并發揮了重要的作用。在國外留學的學生中有3人獲得了美國環境化學優秀研究生稱號。1995年6月，國家環保局、國家教委授予學院“環境教育先進集體”光榮稱號。