北京林業大學研究生院建校五十年來，學校共授予碩士、博士學位1500余人。連續多年畢業生就業率均為100%。為提高研究生培養質量，學校專門設立了優秀博士論文工程、研究生創新實驗中心、研究生培養基金、研究生教改立項和教學用書建設基金、研究生學術交流基金等。

北京林業大學研究生院現有3個一級學科博士學位授予點，28個二級學科博士點、50個碩士點和2個碩士專業學位點（工程碩士和農業推廣碩士）；建有林學、生物學2個博士后流動站。擁有4個國家重點學科、5個部級和市級重點學科、5個部級重點開放實驗室和1個國家理科基地。博士、碩士點覆蓋農學、工學、理學、文學、管理學、經濟學、哲學、法學8個學科門類和27個一級學科。